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开云-从“打酱油”到论文一作,他做出导师“最自豪”的工作—新闻—科学网

发布日期:2024-06-21 作者:开云

2019年末,中国科学院脑科学与智能手艺出色立异中间(以下简称脑智中间)徐春研究员正规画着 放年夜招 :为年夜脑中赫赫有名的海马区绘制一幅三维立体的 交通线路图 。

实现这项工作需要用到年夜量的计较机阐发手艺,而徐春团队主攻功能研究,要找出这么一个IT人材来,还真不轻易。他找了一圈,大都人都不太想接这个 烫手山芋 ,直到邱收走进他的办公室。听完导师徐春对项目标描写后,这个时年25岁、看起来清癯娴静的博士生暗示,他愿意尝尝。

由于邱收并没有计较机根本,开初的打算是他先做着,等后续有更适合的人选时可以退出。没想到不久后的一场正式会议上,这项课题所属的上海市级重年夜专项 小型模式动物全脑神经联接图谱 开云体育app负责人、脑智中间副主任孙衍刚研究员对他说: 这项工作就由你主导了。

就如许,邱收从一个入场较晚的小副角不知不觉间酿成了 男一号 。当初的脑筋一热,让他收成了首篇以第一作者身份颁发的Science论文:《海马区单神经元的全脑投射图谱》。

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颁发论文截图

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师生合影 受访者供图(下同)

揭开年夜脑里的 清明上河图

海马脑区,可以说是最闻名的年夜脑区域之一。徐春笑着把它比作 年夜脑中的向阳区 。

科学家很早就发现海马脑区与记忆功能慎密联系关系。跟着近一个世纪不竭深切的研究,海马脑区还被发现介入了多种分歧年夜脑功能,如惧怕记忆、场景认知、记忆泛化、情感焦炙和社交记忆等。

海马区中千丝万缕、千头万绪的神经元,是若何完成如许复杂的使命的?这个问题恍如藏在一座庞大的迷宫中,让人很难窥得全貌。

徐春团队要做的,就是为海马区成立一个三维立体的 交通线路图 ,让今后的科研工作者都能拿着这份 地图 ,知全局、有标的目的地展开研究工作。

神经元(即神经元细胞)是形态最非凡的细胞之一,乍看像一棵树,颀长曲折如骨干的一端叫轴突,分叉精密如树冠的一端叫树突。神经元最年夜的特点是有标的目的性:神经旌旗灯号老是由树突领受后,再从轴突输出。所谓神经元的 投射 ,就是描写轴突把旌旗灯号输送到哪些处所。

颀长蜿蜒的轴突舒展出去,乃至能笼盖一座年夜楼这么普遍的位置。 徐春向《中国科学报》记者展现他们建造的可视化投射图谱, 你看从这里到这里,只有一条零丁的轴突,但从这个点最先,分离到了很多轴突上。就像一群搭客乘坐飞机,一路达到机场后,很快分离,各奔工具 这就是对 投射 最直不雅的揭示。你还会发现,有些投射没有走直线,而是绕了远路,这可能意味着要完成某个心理功能,需要毗连这么多脑区。就像我们实际糊口中,完成一件工作需要沟通很多本能机能部分。

图片 小鼠海马单细胞全脑投射谱

这幅 交通线路图 不但是立体的,并且是动态的,就像是揭开藏在脑海中的 清明上河图 ,各类神经细胞的神经勾当展现出了不为人知的一面。

我们发现有些齿状回细胞跳过了经典的三突触环路,可以直接投射到海马区外的一些区域。这些现象超出了学术界以往的认知,很是使人振奋。 徐春说。

为研究自学编程, 永久不要限制本身

毫无疑问,这项工作触及年夜量的计较、阐发、编程等工作。而首要完成人邱收此前完全没有相干经验。

为了自学编程,邱收自动从原本的尝试室搬出去,搬到脑智中间扶植的一个公共研究平台 全脑介不雅神经联接图谱研究平台(小鼠)。这里会聚了一批善于数据治理阐发的专业人士。

小半年时候里,邱收就和这些算法工程师们在一个办公室里, 同吃同劳动 ,学到了良多贵重的专业技术。

邱收在实践中发现,这项研究极可能需要用到完全分歧在以往的数据阐发方式。在如许一个重点项目中,要说服大师采取闻所未闻的新方式,需要他本身先把各类备选方式都测试一遍,用现实成果措辞 这可是庞大的工作量。

就在研究如火如荼推动的时辰,邱收生了一场沉痾。在康复后的一段时候里,为了统筹身体疗养和研究进度,导师徐春撑持他居家长途办公。

荣幸总会眷顾时刻尽力的人,这些常日里搭建的长途办公允台,鬼使神差地让邱收后来在上海疫情最严重的时辰,顺遂地完成长途阐发工作,并终究获得了主要冲破。

谈起当初为什么愿意接下如许一个非凡的工作,邱收坦言,他很清晰这是一个需要承当风险的项目,但在这个进程中,他会接触到年夜量可遇不成求的贵重数据,也有机遇做出一些很是主要的功效。

神经科学触及的研究方式很是普遍,你需要进修做手术、连电路、写代码 直到酿成一个多面手。 现在的邱收,俨然是个点满技术树的 斜杠青年 。 如许的履历也提醒我,永久不要限制本身。你感爱好的工作,罢休去做就好,碰到甚么问题就去解决甚么问题。

图片 邱收

今朝,邱收已博士卒业,在脑智中间作为特殊研究助理继续展开工作。他最感爱好的研究标的目的是神经元编码外界信息的机制解析。他但愿找到一个可以展开相干工作的尝试室做博士后研究,也但愿将来能继续和导师徐春合作。

高傲!我为范畴弄 基建

投稿进程中,不止一名审稿人曾建议他们,可以把这篇论文中全海马区的数据拆成数个亚区的部门,别离投稿。

假如如许操作,作者也许会具有更多顶刊论文,但他们仍是决议,颁发一篇最完全、最周全、最能帮忙全球同业的文章。

在这篇论文中,有一个非凡的网址:https://mouse.digital-brain.cn/hipp。

这是他们操纵研究功效搭建起来的小鼠海马区单神经元的全脑介不雅投射图谱数据库。不需要注册账号,打开网页便可以直不雅地看到凝聚了科研人员血汗的 交通线路图 ,还可以自由下载所需要的数据。

论文颁发后,邱收的邮箱里经常会冒出生避世界各地同业的来信,咨询他若何更好地利用这个网站,以帮忙本身展开科研工作。

一名审稿人如许评价: 这个数据集的发生对海马范畴很是主要! 我们已从这篇文章看到了良多新发现的联接纪律。

另外一位审稿人则持续利用了如许的辞汇:让人赞叹的文章(amazing paper),真实的佳构(a real tour-de-force)、不凡的东西(a remarkable tool)。

假如把颁发论文看成最主要的产出,这个课题 性价比 不算高,仿佛是 为他人作嫁衣裳 。

但徐春说: 我们不介怀下笨工夫、苦工夫、慢工夫。相反,这是我迄今为止最高傲的工作。

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徐春

在科研界,要评估一项研究工作的影响力,可以假定这项科研工作没有人做,再过20年,是不是会影响到其他科研工作的进展,有些科学发现会不会是以推延,乃至做不出来。

从这个意义上,徐春相信,他们是在为全部海马区研究范畴弄 基建 ,把地基打好,把桥架好,把唆使牌贴好,今后非论谁想在这个范畴做出一点新工具,都能从中取得便当,获得助力。

成为科研人员以来,我经常想,本身正在研究的问题成心义吗?最少对这项工作,我相信它有着久远的意义。 邱收说。

论文DOI:

10.1126/science.adj919

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